中国医药集团科技研发中心是在四川抗菌素工业研究所的基础上组建成立。经过四十余年的发展，川抗所形成了化学研究部、生物研究部、药理研究部、药物制剂研究部、质量研究部、信息研究部、中药研究室、深圳分所、国家新抗生素工业化试验基地、国家微生物资源菌种保藏中心、国药集团安全评价中心、教育部研究生培养点、抗生素杂志社等研究机构。核心研究领域涉及抗病毒药物、抗肿瘤药物、免疫增强剂和免疫抑制剂等多学科研究领域，尤其在微生物发酵、半合成抗生素、核苷类抗病毒药物等领域具有较大的优势。
在四十多年的发展中，川抗所取得一系列重大科研成果：获得国家发明奖和国家科技进步奖60余项，申请专利50余项，获得新药证书100多项；承担国家“863”、“973”等重大科技攻关项目，科研成果转化率达95%以上，衍生经济效益超过900亿元；在青霉素、链霉素、庆大霉素、克拉霉素等重大科技攻关项目上，树立了川抗所在抗生素药物研发领域不可撼动的坚实地位……
此外，川抗所还积累了一些特色核心资源：一是作为国家微生物资源菌种保藏中心，从1965年开始菌种选育，保藏了从海平面以下至海拔4000多米的大约30000株多样性菌种；二是除具备国际一流的GLP药理实验室和顶级专家队伍之外，还拥有灵长类实验动物资源，这对于取得接近人体特征的试验模型和研究结果具有十分重要的意义；三拥有国家唯一批准设立的新抗生素工业化试验基地，打通了基础研究和工业化生产的屏障，加速了科研成果转化的步伐。
目前，川抗所与俄罗斯国家实验室就酶法生产头孢菌素的项目进行了深入合作；在创新药物研发方面，与英国剑桥大学启动了长效甘精胰岛素和一类创新药全人源-IGE抗体两个研究项目，其中，全人源-IGE抗体已经取得多项国内外专利。
