一些可能影响国家自然科学基金项目推荐的原因：
（1）创新性不强，国内外已有相同或类似的研究，缺少明确的研究假说；
（2）立题依据不充分，研究意义不大，综述不全面，引用参考文献太少或过于陈旧。
（3）经费计算和使用不合理，例如，仪器使用费和论文发表费过高，在职职工给予劳务费，应由课题组成员完成的Western blot等普通实验也列入测试/计算/分析费中，普通动物模型制备费用高达数十万元等等。
（4）“研究内容、研究目标和拟解决的关键问题”是标书应重点阐述的部分，但有的标书写的过于简单，仅仅寥寥几行。
（5）有的标书实验设计欠严密，技术路线缺少可行性，研究方法不够翔实，技术难点未作阐明。
（6）缺少支持所提假说的预实验结果，无法确保课题获得预期进展。
（7）有的研究方案制定的过于复杂，使人怀疑能否不折不扣地完成原定的研究计划。
（8）有的标书要揭示某一疾病的发生机制，但仅采用细胞模型，而没有整体水平的验证，使其价值大打折扣。同时，也使研究计划显得不够饱满。
（9）许多研究内容在预实验中已解决，因此课题完成时间根本不需要4年。有的标书将已完成的研究内容列入到年度的研究计划。
（10）研究时间安排不合理，有的课题组成员高达12月/年，违反国家的有关规定。
（11）有的申请人学术水平不高，无第一作者SCI论文发表；有的无其他课题组成员情况介绍，无法判断研究团队的组成是否合理。
由于国家自然科学基金的资助比例有限，只能优中选优。上述的一些情况，有的时候就成为不同意资助或延缓资助的理由。有的标书创新性强，研究基础好，实验设计也较严谨，只是因为在标书撰写中出现一些不应该出现的错误而被“忍痛割爱”，实在十分可惜。（来源：科学网）
