事实上，除了AFP有助于原发性肝癌的早期诊断，PSA、F-PSA及其比值有助于前列腺癌的早期诊断，其他肿瘤标志物的检测对于肿瘤的早期诊断并不具有很大的意义，其临床价值主要体现在分析疗效、判断预后、预测复发及转移等。肿瘤的早期诊断更多的需要结合病史、症状、体征、影像学检查(B超、CT、X线、胃镜、肠镜)等手段来综合分析，明确诊断则需要依靠病理检查。
误区二：肿瘤标志物阴性就可以排除相关肿瘤
既然多数肿瘤标志物的检测对于肿瘤的早期诊断并不具有很大的意义，那么，肿瘤标志物的阴性也就不能完全排除相关肿瘤。例如胃癌早期仅限于浸润或淋巴转移时血清CA199才明显升高。曾经有一位50岁左右的患者胃病史30余年，加重两周，消化科医生嘱其做胃镜检查，他却以近期CA199、CA50等指标阴性为由拒绝了。半年后出现黄疸，肝功能却无异常，才被迫接受胃镜检查，却发现胃癌已到晚期，勉强手术后一个月就去世了。即使像AFP这种对原发性肝癌的早期诊断具有相当意义的肿瘤标志物，其阳性率也仅达到79%～90%，(AFP诊断原发性肝癌的阳性阈值为>400ng/ml)。也就是说，还有10%～30%的原发性肝癌的患者，AFP是正常的或只有轻度的升高。
误区三：肿瘤标志物异常就可以诊断相关肿瘤
许多良性疾病都可以有肿瘤标志物的异常，如前列腺肥大、前列腺炎可以有PSA的轻、中度升高，子宫内膜异位症可以有CA125的轻、中度升高，急、慢性肝病时可以有CA125、CA199、CA50、铁蛋白的不同程度的升高。胆道疾病伴黄疸时常有CA199、CA50的明显升高，甚至长期吸烟者CEA也会有轻度升高。曾经有一位50岁左右的单纯的乙肝表面抗原阳性者，其CA199一直徘徊在50～70u/ml之间，(正常参考值 ：<37u/ml)，全身检查无任何其他异常，至今已十年有余。
误区四：肿瘤标志物只要联合效率就高
肿瘤标志物的联合应用确实能在一定程度上提高阳性检出率，但部分肿瘤标志物之间的相关性极高，如CA199和CA50之间的相关性可达到95%～98%，即95%～98%的被检者如CA199正常，则CA50也正常，CA199异常，则CA50也异常，这时就可以选用一些灵敏度更高的肿瘤标志物，如CA724。再比如CA242较少受到黄疸的影响，在胆道、胰腺良恶性疾病的鉴别诊断中具有较高价值。
误区五：肿瘤标志物的轻度升高价值不大
正因为许多良性疾病都可以有肿瘤标志物的异常，所以有些医生认为肿瘤标志物的轻度升高价值不大，只有在高于正常参考值5倍以上才有意义。事实并非如此，因为在大多数情况下，正常参考值的范围都订得比较宽。因此，在排除了良性疾病以后，即使是肿瘤标志物的轻度升高同样有很大价值。曾经有一位患者，其CA199、CA50都只是轻度升高，经反复检查，最后通过增强CT查出了胆囊癌，在及时手术以后，至今已存活3年。
临床上，对于肿瘤标志物的应用应该是既不迷信，也不轻视，根据不同情况、不同目的选择或联合使用之。
