细胞培养中的边缘效应是指在使用多孔板的细胞培养中，在周边孔中的细胞会集中在孔的外侧，如图所示（孔内白亮的为细胞集中的区域）。这种现象在实验中常用的96孔板中十分明显。
由于大多细胞的生长会受周围接触细胞的抑制，所以边缘效应导致边缘孔内细胞平均生长速度要比其他孔来得慢，从而在实验过程中引入系统误差。在很多大规模药物筛选实验中，人们甚至弃去周围孔的实验结果。
边缘效应是由于在室温下的培养板转移到37℃培养箱后，培养板上产生的温度差影响细胞沉降引起的。所以解决边缘效应的一个简单有效的方法，就是在培养板内分入细胞后，在室温下放置1-2个小时，让细胞在没有温度差的情况下沉降，然后再转移到37℃培养箱内。该方法至少适合CHO等在室温下能贴壁的细胞。
