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实验技术 > 分子生物学实验 > 分子生物技术 > 分子生物学实验中常用的“工具”

分子生物学实验中常用的“工具”

最后更新:2010-5-11 阅读次数: 【字体:

载体

1)载体(vector):运载外源DNA有效进入受体细胞内的工具。

2)载体同外源DNA在体外重组成DNA重组分子,在进入受体后形成一个复制子,即形成在宿主细胞内能独立进行自我复制的遗传因子。

3)载体应该满足以下几方面的要求:

(1)有许多种限制酶切点,且每种酶的切点只有一个;

(2)外源DNA插入后不影响载体的自我复制,对受体细胞无害;

(3)能接纳尽可能大的外源DNA片段;

(4)有可供选择的标记基因,有利于筛选含重组载体的转化子;

(5)具有促进外源DNA表达的调控区。

4)重组DNA技术中常用载体

质粒、噬菌体λ、柯斯质粒(cosmid)和噬菌体M13

5)受体细胞:大肠杆菌(E.coli)

  常用菌株:DH5α,JM109等

6)共同特点:

(1)容易进入宿主细胞,而且进入效率越高越好;

(2)能在大肠杆菌中自主复制;

(3)有可选择的,便于筛选、鉴定的遗传标记;

(4)有供外源DNA插入的位点;

(5)自身体积小,很容易同细菌DNA分开并加以纯化。

质粒

1)质粒(plasmid):细菌或细胞染色质以外、能自主复制、且与细菌或细胞共生的遗传成分。质粒是染色体(核)以外的独立遗传因子,存在于多种细菌细胞内,控制细胞某些特定的遗传形状。

2)双链环状DNA组成,几乎完全裸露,很少有蛋白质结合。

3)质粒的特点:

(1)染色质外的双链共价闭合环形DNA,大小在2-300kb;

(2)能自主复制,且可随宿主细胞分裂而传给后代;

严密控制型质粒:复制与宿主的繁殖偶联,拷贝数较少

松弛控制型质粒:复制与宿主的繁殖不偶联,拷贝数多

(3)质粒对宿主生存并非必需。

4)用途:常规克隆、原核表达、转基因载体。

5)分子生物学实验中常用质粒的特征:

(1)多拷贝,一个细胞可复制30-50个质粒;

(2)含多个基本基因:复制原点Ori——复制扩增

抗性标记——转化筛选

乳糖操纵子——插入筛选

(4)多克隆位点:外源DNA插入

噬菌体载体

1)噬菌体(phage):感染细菌的一类病毒。

2)基因组分三个区域:左侧区、中间区(非必需区)、右侧区

3)常用:EMBL系列、λgt系列

4)人工改造的噬菌体载体

(1)设计去除λDNA上的一些限制性酶切点;

(2)在非必需区,替换插入标志基因和多克隆位点。

5)λ噬菌体作载体

(1)插入型载体:容许插入5-7kb外来DNA,如λgt系列;

(2)转换型载体:用外来DNA替代中段。

6)主要用途:构建cDNA文库或基因组文库

柯斯质粒

1)柯斯质粒(cosmid):由正常质粒的复制序列、标志基因、多克隆位点同λ噬菌体的cos位点构成。

2)插入的外源DNA可大于40kb。

3)重组柯斯质粒像λ噬菌体一样感染大肠杆菌,并进行复制。

4)柯斯质粒作载体的困难:

(1)载体自身连接;

(2)每个载体可能插入多个外源片段;

(3)筛选费时。

5)用途:构建基因组文库

单链噬菌体载体

1)M13是丝状噬菌体,长6.4kb的闭环DNA基因组;

2)当M13进入细菌后,单链DNA转变成双链复制型;

3)M13中除有一段507个核苷酸,其余均与复制有关,可在这一段中插入外源DNA;

4)用途:DNA测序;单链的DNA探针

BAC载体——细菌人造染色体

1)细菌人造染色体:被克隆到细菌中的来自其他物种的大片段DNA,并在宿主细菌中产生大量拷贝。

2)BAC的优点:

(1)易于用电击法转化E.coli(效率比酵母高10-100倍);

(2)超螺旋环状载体,易于操作;

(3)F’质粒本身所带的基因控制了质粒的复制;

(4)很少发生体内重排。

3)用途:克隆大片段DNA,100-300kb

YAC载体——酵母人造染色体

1)酵母人造染色体:将来自其他物种的较大片段DNA连接到酵母DNA上,在宿主细胞中外来DNA能随着酵母细胞中的其他染色体一起复制。

2)有三种必需成分:着丝粒、端粒和复制起点

(1)着丝粒(CEN)位于染色体中央:接收信号使姐妹染色体分开

(2)端粒(TEL):防止染色体融合、降解、确保其完整复制

(3)复制起点:DNA复制由起始蛋白与特定DNA序列互作开始

3)用途:克隆大片段DNA,100-200kb

4)主要缺点:

(1)存在高比例的嵌合体,一个克隆含两个不相连的独立片段;

(2)部分克隆子不稳定,转代培养中可能会发生缺失或重排;

(3)难与酵母染色体区分开,因为YAC与酵母染色体有相似结构;

(4)操作时容易发生染色体机械切割。

5)正常酵母人工染色体含有:

(1)四膜虫端粒(tel)

(2)酵母自主复制序列(ARS)

(3)酵母着丝粒(CEN)

(4)酵母选择标记(TRP1、URA1)

表达载体

1)特点:带表达构件——转录和翻译所需的DNA序列

2)大肠杆菌表达载体

启动子——核糖体结合位点——克隆位点——转录终止信号

启动子:trp-lac(tac)启动子、λ噬菌体PL启动子、T7噬菌体启动子

核糖体结合位点(RBS):起始密码子(ATG)和SD序列

转录终止序列

3)用途:表达外源目的基因,获得重组融合蛋白

大肠杆菌原核细胞表达

1)表达载体:较常用的是具可诱导的T7启动子的表达载体,大部分蛋白可获得表达而且表达量较高 (占细菌总蛋白的25%以上)。

2)寄主菌:细菌染色体上含有噬菌体T7-RNA聚合酶基因,它的启动子为Lac启动子,可被IPTG诱导。

3)融合蛋白:常用6-10组氨酸-融合蛋白,只增加几个氨基酸,对蛋白质结构影响较少。 GST-融合蛋白,选择大肠杆菌偏爱密码子,易表达外源蛋白。融合蛋白有利于表达和纯化。

4)用途:获得融合蛋白,用于抗体制备,生化性质研究等。

植物转化载体

1)用于植物转化的载体有两类:Ti类质粒载体和病毒载体

2)Ti类质粒载体:Agrobacterium tumerfaciens

3)6个功能区:

(1)致癌区(合成生长素和细胞分裂素)

(2)冠瘿碱合成区

(3)冠瘿碱分解区

(4)Ti质粒接合转移区(tra)

(5)毒性区(Vir)

(6)DNA复制区(Rep)

4)植物双元载体:能在E.coli和农杆菌中复制的广谱宿主载体。

(1)复制起点

(2)两个T-DNA边界顺序

(3)各种标记基因

原核选择标记:卡那霉素

植物选择标记:潮霉素

(5)多克隆位点

5)农杆菌:存在一种 T-DNA已丢失的Ti质粒,帮助重组双元质粒上的T-DNA转移到植物细胞中。

提示:本文分子生物学实验中常用的“工具”属于分子生物技术文章,主要介绍分子生物学方面的知识,内容仅供学习交流与参考,不代表中生网的观点。
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