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实验技术 > 分子生物学实验 > 分子生物技术 > 毕赤酵母表达实验方法

毕赤酵母表达实验方法

最后更新:2010-7-20 阅读次数: 【字体:
一.毕赤酵母表达常用溶液及缓冲液的配制

1.1 各种母液的配制

10*YNB (含有硫酸铵、无氨基酸的13.4%酵母基础氮源培养基) 4℃保存。34g酵母基础氮源培养基(无硫酸铵)+100g硫酸铵,溶于1000ml水中,过滤除菌。

500*B     (0.02%生物素 Biotin)   4℃保存 保存期为1年。20mg的生物素溶于100ml水中,过滤除菌。

100*H     (0.4%Histidine 组氨酸) 4℃保存 保存期为1年。400mg的L-组氨酸溶于100ml水中,(加热至50℃以促进溶解),过滤除菌。

10*D (20%Dextrose 葡萄糖) 保存期为1年。200g葡萄糖溶于1000ml水中,灭菌15min或过滤除菌。

10*M (5%Methanol   甲醇) 保存期为2个月。将5ml的甲醇与95ml水混匀,过滤除菌。

10*GY (10%Glycerol   甘油) 保存期为1年以上。将100ml甘油和900ml水混匀后,高压灭菌或过滤除菌。

100*AA (0.5% of each Amino Acid,各种氨基酸)   4℃保存 保存期为1年。分别将500mg的L-谷氨酸、L-蛋氨酸、L-赖氨酸、L-亮氨酸和L-异亮氨酸溶于100ml水中,过滤除菌。

1M 磷酸钾溶液(potassium phosphate buffer,pH6.0),将1mol/L的K2HPO4溶液132ml与1mol/L的KH2PO4溶液868ml混匀,其pH为6.0,如需调节pH,则使用磷酸和氢氧化钾调节pH。

1.2 常用溶液及缓冲夜

1.2.1 碱裂解法抽提质粒DNA所用溶液:

溶液Ⅰ:50mmol / L glucose,100mmol / L EDTA,25mmol / L Tris-HCI (pH 8.0)

溶液Ⅱ:0.2mol/L NaOH,1% SDS(临用时配制)

溶液Ⅲ:29.44g KAc,11.5ml Acetic acid,加ddH2O至100 ml。

4℃保存。

1.2.2 10% 甘油 (Glycerol):

将100ml甘油和900ml水混匀后,高压灭菌或过滤除菌。保存期为1年以上。

1.2.3   Rnase-H2O:

1ul Rnase 加入1ml 灭菌 dd H2O。4℃保存。

1.2.4   TE缓冲液:

10mmol / Tris-CI(pH 8.0), lmmol / L   EDTA(pH 8.0)

1.2.5   STE缓冲液:

0.1mol / L,   10mmol / L Tris-HCl (pH 8.0), 1mmol / L EDTA (pH 8.0)

1.2.6   SCE缓冲液:

1mol / L Sorbitol (山梨醇), 10mmol / L 柠檬酸钠 , 10mmol / L EDTA

1.2.7   1M potassium phosphate buffer (pH 6.0):

    132 ml 1M   K2HPO4

    868 ml 1M   KH2PO4

1.2.8 50X TAE 琼脂糖凝胶电泳缓冲液,pH 8.0(1L):

   242 g Tris

   57.1 ml Acetic Acid

   37.2 g EDTA

二.毕赤酵母表达的培养基配制

2.1   LB(Luria-Bertani)培养基:

Trypton     l%

 Yeast Extract 0.5%

 NaCl    l%

 PH 7.0

制作平板时加入 2%琼脂粉。121℃高压灭菌 20min。可于室温保存。用于培养pPICZαA原核宿主菌TOP10F’时可加入Zeocin 25ug / ml。

2.2   LLB(Low Salt LB)培养基:

Trypton     l%

 Yeast Extract 0.5%

 NaCl     0.5%

 PH 7.0

制作平板时加入 2%琼脂粉。121℃高压灭菌 20min。可于室温保存数月。用于培养pPICZαA原核宿主菌TOP10F’时,加入Zeocin 25ug / ml,可以4℃条件下保存1~2周。

2.3   YPD (又称YEPD)

Yeast Extract Peptone Dextrose Medium,(Yeast Extract Peptone Dextrose Medium,酵母浸出粉/胰蛋白胨/右旋葡萄糖培养基)

Trypton    2%

dextrose (glucose) 2%

+agar        2%

+Zeocin 100 µg/ml

液体YPD培养基可常温保存;琼脂YPD平板在4℃可保存几个月。加入Zeocin 100ug / ml,成为YPDZ培养基,可以4℃条件下保存1~2周。

2.4   YPDS + Zeocin 培养基(Yeast Extract Peptone Dextrose Medium):

yeast extract     1%

peptone    2%

dextrose (glucose) 2%

sorbitol    1 M

+agar        2%

+ Zeocin    100 µg/ml

不管是液体YPDS培养基,还是YPDS + Zeocin 培养基,都必须存放4℃条件下,有效期1~2周。

2.5   MGY

Minimal Glycerol Medium (最小甘油培养基)

(34%YNB;1%甘油;4*10-5%生物素)。将800ml灭菌水、100ml的10*YNB母液、2ml的500*B母液和100ml的10*GY母液混匀即可,4℃保存,保存期为2个月。

2.6   MGYH

Minimal Glycerol Medium + Histidine (最小甘油培养基 + 0.004%组氨酸)

在1000ml的MGY培养基中加入10ml的100*H母液混匀,4℃保存,保存期为2个月。

2.7   RD

Regeneration Dextrose Medium (葡萄糖再生培养基)

(含有:1mol/L的山梨醇;2%葡萄糖;1.34%YNB;4*10-5%生物素;0.005%氨基酸)

1. 将186g的山梨醇定容至700ml,高压灭菌;

2. 冷却后于45℃水浴;

3. 将100ml的10*D、100ml的10*YNB;2ml的500*B;10ml的100*AA等母液和88ml无菌水混匀,预热至45℃后,与步骤2的山梨醇溶液混合。4℃保存。

2.8   RDH

Regeneration Dextrose Medium + Histidine (葡萄糖再生培养基 + 0.004%组氨酸)

在RD培养基配制的第三步中,在加入10ml的100*H母液,同时无菌水的体积减少至78ml即可,其余配制方法与RD相同。4℃保存。

2.9   RD及RDH平板的制备

1. 将186g的山梨醇和15~20g琼脂粉定容至700ml,高压灭菌;冷却后于60℃水浴;

2. 参照RD/RDH液体培养基配制的步骤4,将100ml的10*D、100ml的10*YNB;2ml的500*B;10ml的100*AA等母液、(10ml的100*H母液)和88(78)ml无菌水混匀,预热至45℃后,与步骤1的山梨醇/琼脂液混匀;

3. 迅速制备平板。4℃可保存数月。

2.10   RD及RDH 的TOP 琼脂的制备(常用于酵母菌的包被)

1.将186g的山梨醇和7.5~10g琼脂粉定容至700ml,高压灭菌;冷却后于60℃水浴;

2.参照RD/RDH液体培养基配制的步骤4,将100ml的10*D、100ml的10*YNB;2ml的500*B;10ml的100*AA等母液、(10ml的100*H母液)和88(78)ml无菌水混匀,预热至45℃后,与步骤1的山梨醇/琼脂液混匀;

3.将该TOP琼脂置于45℃水浴冷却、保温,备用。

2.11   MD与MDH

Minimal Dextrose Medium +(Histidine)   最小葡萄糖培养基 +( 0.004 %组氨酸)

(含有:1.34%YNB;;4*10-5% 生物素;2%葡萄糖)

1. 100ml的10*YNB;2ml的500*B和100ml10*D母液,用800ml的无菌水定容至1000ml即可;

2. 如配制MDH,可在上述的MD中加入10ml的100*H即可;

3. 如配制平板,可无菌水的灭菌前,加入15~20g的琼脂。4℃可保存数月。

2.12   SOC培养基:

Trypton       l%

Yeast Extract    0.5%

NaCl       0.05%

Glucose (1mol / L)     2%

121℃高压灭菌 20min,冷却后,4℃保存

三.主要试验环节的操作

3.1 酵母菌株的分离纯化

接种GS115于5ml YPD液体培养基,30℃,200rpm振荡过夜,涂布 YPD平板,30℃培养48 小时,用 YNB基本培养基和含His的补充培养基作点种分离纯化,挑选在补充培养基生上生长而在基本培养基上不生长的单菌落划YPD平板,4℃保存。

3.2 pPICZαA原核宿主菌TOP10F’的活化培养

TOP10F’做为菌种保存在-70 ℃条件下,在进行扩大培养抽提质粒之前,先要进行活化培养。

接种TOP10F’于5ml LLB(加入25ug / ml Zeocin)中,37℃,200 rpm ,培养16~18小时。

3.3毕赤酵母表达的试验方法

3.3.1线状质粒DNA的脱磷酸化处理

为了防止载体质粒DNA的自身环化,用小牛肠碱性磷酸酶(CIP)处理酶切后的质粒DNA,具体操作如下:

⑴ 建立反应体系:

线性化的质粒     35ul

10x CIP buffer   4ul

CIP              1ul

ddH2O            5ul

——————————————————————————

total     45ul

⑵ 在PCR仪上控制反应温度(加石蜡油封闭),37℃,15 min ;50℃,15 min;56℃,30 min(灭活)。

⑶ 在56℃未开始前停止,加入proteinse K ,用于灭活CIP,加入试剂如下:

反应物           45ul

10x 5% SDS       7ul

10x EDTA (pH 8.0) 7ul

proteinse K       5ul

 ddH2O           6ul   

———————————————————

  total       70ul

⑷ 纯化使用QIAquick spin kit ,按照2.2.3.3步骤进行,20 ul 灭菌ddH2O洗脱纯化产物。进行1%琼脂糖凝胶电泳,120 V, 观察纯化结果,并大约估计DNA浓度。

3.3.2   E.coli TOP10F’ 感受态细胞的制备及转化

⑴ 取10 ul TOP10F’ 菌液,接种于 200ml LB液体培养基中活化培养,37℃ ,200 rpm,16~18小时。取100 ul菌液接种于 200 ml 液体LB培养基中。

⑵ 37℃ ,200 rpm,培养16~18小时。

⑶ 灭菌500 ml 离心管,4℃,4000 rpm,20 min 。得菌体沉淀。弃上清,菌体用10%甘油重悬并洗涤。重复洗涤3次。

⑷ 第三次离心后,弃绝大部分上清,留下约1ml 液体用于重悬菌体。

⑸ 从制得得感受态细胞中,取200 ul于灭菌EP管中,加入连接反应产物 5ul ,混匀,不要产生气泡,在冰上放置 5 min。

⑹ 将混匀后得200ul菌液移入电击杯中。

⑺ 使用电击穿孔仪进行转化,设置为 电压 2500 V,时间 5 ms。

⑻ 电击后,往电击杯中加入 800ul SOC培养基,冲洗出菌体,转移至灭菌1.5 ml EP管中。37℃,150 rpm ,轻摇45~60 min。

⑼ 取全部均匀涂布于含 Zeocin 25 ug/ml 的LLB-Zeocin平板上,正放,待涂布液不在流动,37℃ 培养12~16小时。

*注:设空载体做对照。

3.4   毕赤酵母电转化方法

3.4.1 菌体的准备:

1. 挑取酵母单菌落,接种至含有5ml YPD培养基的50ml三角瓶中,30℃、250~300r/min培养过夜;

2. 取100~500µl的培养物接种至含有500ml新鲜培养基的2L三角摇瓶中,28~30℃、250~300r/min培养过夜,至OD600达到1.3~1.5;

3. 将细胞培养物于4℃,1500g离心5min,用500ml的冰预冷的无菌水将菌体沉淀重悬;

4. 按步骤3离心,用250ml的冰预冷的无菌水将菌体沉淀重悬;

5. 按步骤3离心,用20ml的冰预冷的1mol的山梨醇溶液将菌体沉淀重悬;

6. 按步骤3离心,用1ml的冰预冷的1mol的山梨醇溶液将菌体沉淀重悬,其终体积约为1.5ml;

7. 备注:可将其分装为80µl一份的包装冷冻起来,但会影响其转化效率(2周之内)。

3.4.2 电击转化:

8. 将5~20µg的线性化DNA溶解在5~10µl TE溶液中,与80µl的上述步骤6所得的菌体混匀,转至0.2cm冰预冷的电转化杯中;

9. 将电转化杯冰浴5min;

10. 根据电转化仪提供的资料,参考其他文献及多次摸索,确定合适的电压、电流、电容等参数,按优化的参数,进行电击;

11. 电击完毕后,加入1ml冰预冷的山梨醇溶液将菌体混匀,转至1.5ml的EP管中;

12. 将菌体悬液涂布于MD或RDB平板上,每200~600µl涂布一块平板;

13. 将平板置于30℃培养,直至单个菌落出现。

推荐:电压1.5kV;电容25µF;电阻200Ω。电击时间为4~10msec。

提示:本文毕赤酵母表达实验方法属于分子生物技术文章,主要介绍毕赤酵母操作步骤方面的知识,内容仅供学习交流与参考,不代表中生网的观点。
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