“选择”（selection）和“筛选”（screening）的基本含义。
选择，是指通过某种外来附加压力（或因素）的辨别作用，呈现具有重组DNA分子的特定克隆类型的一种方法。选择所涉及的范围较为广泛，包括根据克隆载体提供的表型特征的简单选择（simple selection），和根据突变的互补作用对克隆基因的直接选择（direct selection）。
筛选则是指通过某种特定的方法，从被分析的细胞群体或基因文库中，鉴定出真正具有所需要重组DNA分子的特定克隆的过程。
一．遗传检测法
（1）根据载体表型特征选择重组体分子的直接选择法
在基因工程中使用的所有的载体分子，都带有一个可选择遗传标记或表型特征。遗传选择法使我们能够将重组体的DNA分子同非重组体的亲本载体分子区别开来。
（i）抗药性记号插入失活选择法
pBR322质粒具有编码有四环素抗性基因（tetr）和氨苄青霉素抗性基因（ampr），只要将转化的细胞培养在含有四环素或氨苄青霉素的生长培养基中，便可以容易地检测出获得此种质粒的转化子细胞。
（ii）β-半乳糖苷酸显色反应选择法
根据插入失活原理，将外源DNA插入到它的lacZ基因上所造成β-半乳糠苷酶失活效应，可以通过大肠杆菌转化子菌落在Xgal-IPTG培养基中的颜色变化直接观察出来。β-半乳糖苷酶会把乳糖水解成半乳糖和葡萄糖。
（2）根据插入序列的表型特征选择重组体分子的直接选择法
这种选择法依据的基本原理是，转化进来的外源DNA编码的基因，能够对大肠杆菌寄主菌株所具有的突变发生体内抑制或互补效应，从而使被转化的寄主细胞表现出外源基因编码的表型特征。
