各种蛋白质分子上可能带有不同的电性，经过离子交换管柱，可依其分子带电性的差异而分离开来 。
仪器设备：
塑料管柱 （Bio-Rad Econo-Pac column 732-1010, 1.5×12 cm）
部分收集器 （fraction collector, 另需准备干净试管约60 支）
浓缩用离心机 （低速5,000 rpm） 及浓缩离心管Centriplus
药品试剂：
DEAE Sephacel （胶体体积约15 mL,预先以缓冲液Buffer A-0 平衡好）
Buffer A-0 （如上述配法）
Buffer A-300 溶离液：Buffer A-0 加有0.3 M NaCl
Buffer A-500 溶离液：Buffer A-0 加有0.5 M NaCl
方法步骤：
1） 将Econo-Pac 管柱架好，并将三向阀及软管等组合完成。
2） 震荡DEAE Sephacel 胶体使的悬浮，小心倒入管柱中，让胶体慢慢沈降，在沈降过程中随时加入buffer A-0,勿使胶体干掉。
3） 待胶体沈降完全后，高度应在15 cm 左右。胶柱以buffer A-0 一直流洗，流速快慢可以不考虑；连接好收集器，每试管收2.5 mL.离子交换法的胶体平衡极为重要，可测流出液的pH 或离子浓度，看是否与buffer A-0 相同，若不一样则需要再流洗的。
4） 样本的添加方法同上述胶体过滤法，并启动部分收集器开始收集，当样本全部没入胶体后，再加入同体积buffer A-0.以buffer A-0 流洗50 mL 后，去除胶体上方的缓冲液，但勿使胶体干掉。
5） 然后依序以buffer A-300, buffer A-500 溶离的，每批次流洗各50 mL,注意更换浓度时，胶体上方勿残存上一种溶液。
6） 收集后，进行蛋白质定量分析以及GUS 活性测定，结果作图。
7） 收集GUS 活性区，并以Centriprep-30 浓缩至 _______ mL （IEX），记得要保留100 μL.
8） 离子交换胶体以buffer A-0 洗过50 mL 后，收起来交回。
