蛋白结构预测几种方法

PHD PHD是根据多重序列比对预测1D结构（二级结构，可溶性）的程序。

PHDsec PHDacc PHDhtm 分别是根据多重序列比对预测二级结构（PHDsec），每个残基的可溶性（PHDacc），跨膜螺旋的位置和拓扑学结构（PHDhtm）的方法。

PROF PROF是对PHD的改进，使用基于profile的神经网络算法预测蛋白结构。

PROFsec PROFacc 分别是对PHDsec和PHDacc改进，使用基于profile的神经网络算法预测蛋白二级结构和残基可溶性。

GLOBE GLOBE对蛋白质的球状区域进行预测。

TOPITS TOPITS是一个基于预测的线索化程序，在DSSP数据库中查找远源同源序列。

AGAPE AGAPE是一个基于预测的折叠识别程序，在PDB数据库中查找远源同源序列。

http://www.predictprotein.org

COILS COILS 用于寻找蛋白中的卷曲螺旋。

DISULFIND DISULFIND预测二硫键。

http://cassandra.dsi.unifi.it/cysteines/index.html

ASP ASP预测结构转化区。

Sandia National Lab

PROFcon PROFcon预测单链中残基对之间的联系。