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软件教程 > 生物软件教程 > Imagepro plus应用实例:脑缺血梗死面积的测量

Imagepro plus应用实例:脑缺血梗死面积的测量

最后更新:2010-11-17 阅读次数: 【字体:

一、首先是拍摄切片的注意事项:

1.选择黑色毛面的实验台面作背景,或者用黑纸作背景。

2.将脑片整齐地排列在桌面上,要注意正反面的方向。用滤纸将切片表面的水迹吸干,桌面上的水渍也要尽量吸干净。

3.使用普通数码相机即可,不要使用闪光灯,最好用手动方式调节焦距、光圈与快门。注意背景是黑的,照出来的照片上背景也要黑,这样样品才会曝光适度。如果用自动功能,很容易曝光过度。

4.计算体积时一般是计算梗死体积占全脑体积的比例,所以标尺不是必须要加的。

下面图片上两张照片各有缺陷,左边的照片曝光过度,对焦不清晰。右边的图片照明稍不均匀,切片上的水迹有反光点,这些反光点会影响测量(点击图片看大图就能看清反光点)。

二、先在IPP中对图片的缺陷作适当的修饰。

使用contrast enhencement工具调整一下亮度下限,使得背景全黑。记得调好后要点一下apply按纽。

三、用filter的median工具能有效去除那种细小而明亮的斑点。

三、现在可以测量了,先测量脑片本身的截面积。

使用segmentation选色时,只需选择I的值10-255就能把脑片从黑色背景中分离出来。

因为脑片本身是红色,所以使用绿色作标记色能够使选择更准确。

四、回到count/size上,点count,结果就有了。这个图片上的效果只需在count窗口里的option中设置一下就行。

要注意右下角的样品与标记纸连到一起了,数据当然是错误的。可以用count/size中的edit split功能把它们俩分开。右边的一些杂点就不管它们了。由此可见,照片照干净点,测量起来会省很多事。

五、下一步再测量缺血部位的截面积。

缺血部位是白色,亮度很高,所以简单选择I的下限为一个较高的值就能选择到。

六、回到count/size窗口点count,这回会测量出很多区域,有一些并不是缺血区域。把图片放大一点,用edit toggle工具把那些错误的区域删除掉。

最后的体积计算也不复杂。简单地把脑片面积相加作分母,缺血面积相加作分子,就是缺血部位与全脑的体积比例了。

提示:本文“Imagepro plus应用实例:脑缺血梗死面积的测量 ”属于生物软件教程文章,主要介绍Imageproplus方面的知识,内容仅供学习交流与参考。
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