自己直接从NCBI对测序结果直接Blast，获得的比对结果选取同源性大于96%的序列，直接Download另存为.fasta格式。
直接用MEGA打开一个序列，对下载的每个序列用记事本打开，检查序列的格式是否统一，再通过该软件的菜单栏的Edit→Insert Sequence From File(添加所要比对的的序列)→Alignment→Align by ClustalW→出现的界面点击 OK→Data→Expert Alignment→MEGAFormat(保存该文件并命名)→出现界面Protein Coding Nucleotide Sequence Data→点击NO→关闭该比对界面→出现界面Open The Data File in MEGA→点击YES→出现一个新界面，不用管它，点击另一个界面菜单 Phylogeny→BootstrapTest of Phylogeny→根据需要选择自己所要的进化树结构类型。
进化树分析软件MEGA 4.1 Beta 3 免费下载：http://www.seekbio.com/soft/148.html
